حذّر د. نافع على نافع مستشار رئيس الجمهورية السابق من مشاركة الجيش الشعبي في حماية ترتيبات الاستفتاء الخاص بتقرير مصير جنوب السودان . ورهن نافع نزاهة وعدالة الاستفتاء بشرطين هما عدم تدخل الجيش في ادارة او مراقبة عملية الاستفتاء اتعاظاً من تجربة الانتخابات السابقة وان تبدي القوى السياسية موقفها حول وحدة او انفصال جنوب السودان وبحسب صحيفة آخر لحظة طالب نافع المجتمع الدولي بعدم التدخل في القضايا المتعلقة بالاستفتاء .