أكدت الحركة الشعبية إنها تمتلك الحرية في التعامل مع اي حزب ، وأشارت الي ان تعاملها مع المؤتمر الوطني يدخل في خصوصية تعاملها مع القوى السياسية . وقال الدكتور رياك مشار نائب رئيس الحركة نائب رئيس حكومة الجنوب نحن أحرار في تعاملنا مع اي حزب ، واضاف المؤتمر الوطني شريك لنا في الحكم ، واوضح نحن نتعامل مع كل الاحزاب بما فيها المؤتمر الشعبي وزاد لا يوجد ما يمنعنا من التعامل مع المؤتمر الوطني . وقطع مشار بصحة عدم وجود مسلم في حكومة الجنوب ، لكنه أشار لعدم تشكيل الحكومات بالأديان ( وهذا مسلم وهذا غير مسلم ) مؤكداً عدم وجود مايمنع من مشاركة المسلمين في حكومة الجنوب . وحول ما رشح عن إنشقاق آخر للحركة قال مشار لايوجد إسم قيادي في الأسماء المؤسسة ، وأضاف نحن سنستفسر من قواعدنا المنتشرة في أنحاء السودان ، وبحسب صحيفة آخر لحظة كان الدكتور حسن الترابي قد صوب إنتقادات للحركة بالجنوح للمؤتمر الوطني واشار لخلو حكومة الجنوب من اي مسلم ، في وقت ترددت فيه الأنباء عن إنشقاق آخر بالحركة الشعبية .